Adagumer, просто дело привычки. В центре приложений который сегодня является стандартным для всех дистрибутивов (по сути это компонент Гнома) можно ставить, удалять и читать описание (иногда на русском).
Мне кажется (без претензий на истину), что стандартизация менеджера приложений по DE - это более правильно. У Гнома свой менеджер, у КДЕ свой. Так в любом дистрибутиве эти утилиты остаются неизменными, что добавляет удобства как пользователю, так и разработчикам.
Вот сейчас удалял программу прямо из меню - на мой взгляд - удобно