Пока ничего сказать не могу, вроде все в порядке.
Единственное, что приходит в голову - это дождаться, когда исчезнет нормальное декодирование и тут, ничего не выключая и не перезапуская программ, подать на вход генератор и посмотреть форму сигналов на осциллограмме.
На предыдущей Вашей картинке от версии 1.3. видно, что нет характерных точек-тире с соотношением ~1/3. Вот в этот момент и подать на вход генератор.