Вопрос не до конца понятен. Если нужен вырез, точнее фрезеровка прямоугольного отверстия в плате под транзистор для дальнейшей передачи в Гербер, то нужно сделать в слое К (белый) очертить контур выреза. Таким же контуром являются и внешние границы печатной платы. Если нужно просто убрать слой фольги, то это нужно сделать как советовал Jose. Но в этом случае при передаче в Гербер там не будет фольги, но текстолит вам не отфрезеруют.