Есть и сомнение для безусловного состояния (H -> в лог "H") при управлением с уровень "H" с PCF8574 (U5 -> Q2), где IoutH около 100 μА (где-то 300 140 μА, на китайских ИС -> IoutHmax = 140 μА). Tакже много pull-up резисторов 1 кОм по шине I2C. У модуля Si5351 есть, еще 2 комплекта по 1 кОм вижу.
Резисторы R7..R10 = 330 Ом к D4..D7 LCD с какой целью? LCD с 4 pin к Ардуино? Это модуль? Енкодер, шаг есть возможность переключать?